微刺激方案花費少，可以連續多次取卵，獲得的成熟卵子數目雖少，但卵子質量較高。這樣可以爭取時間、多次取卵以便攢夠足量優質胚胎，從而進行凍胚的移植（應用熒光原位雜交技術對移植前胚胎進行篩選，發現微刺激方案獲得的正常胚胎率高于常規方案）。可達到較為滿意的成功率。

微刺激方案減少促排藥物劑量、縮短治療時間（半月時間），通過增加周期數獲得更優質的胚胎，一個周期的花費少（大概1.8萬元），這一優點也得到許多嚴重少精癥、畸精癥、梗阻性無精癥患者的青睞，可以安全的獲得多個卵子與質量差一些的精子結合，從多個胚胎里選擇最優質的胚胎進行移植。

臨床實踐證實：對卵巢反應差者，即便加大促排藥物劑量并不能顯著增加卵泡數目、改善卵子質量及提高妊娠率，同時還面臨大劑量促排藥物刺激帶來的副反應和昂貴的費用。微刺激方案減少促排藥物劑量、縮短治療時間，通過增加周期數獲得更優質的胚胎從而爭取理想的妊娠率。